一、高校經濟責任審計中存在的問題
高等院校在經濟責任審計中由于起步較晚，還存在著一些難以解決的問題：
1、單一審計效果不佳
在實施審計過程中，審計人員一般采用分別審計不同領導，并單獨實施某一位領導的任前審計、任期審計或離任審計，這樣不僅不容易找到問題，還無形中大大增加了審計人員自身的工作量。
2、審計資源稀缺與任務繁重的矛盾。
由于審計部門的編制有限，高校院一級審計部門人員很少，完成預算、決算、基建、專項效益、法紀等審計任務已經是超負荷運轉，再來實施時間緊、工作量大的領導干部經濟責任審計，人力資源顯得更加緊張。
3、缺乏行之有效的經濟責任審計評價體系。
在經濟責任審計中，審計評價內容過于全面化。表現為：一是充分肯定責任人的成績，如實指出存在的問題，分析問題產生的原因，這種對成績、問題、分析的全面評價實質上是避重就輕的評價，不利于審計目標的實現;二是把被審計單位的社會效益、精神文明建設和思想政治工作納入審計評價內容;三是把被審計單位可持續發展也納入評價內容，增加了審計評價的難度，加大了審計風險。
4、部分審計人員的素質不能適應經濟責任審計要求，加大了審計風險。
由于經濟責任審計對象特殊，這就決定了審計工作涉及的知識面廣、質量要求高、政策性強，必須要求審計人員具備有較高的政策水平，較強的業務能力和較強的綜合分析能力。目前大多數審計人員所具備的水平，難以適應需要。
以上問題和困難的存在，需要采取切實措施，逐步予以解決，以促進高校領導干部經濟責任審計工作的健康開展。
二、高校經濟責任審計改革措施
筆者認為，針對目前高校經濟責任審計中存在的問題，應當從以下幾個方面進行改革：
1、實施多元化審計與動態審計
離任審計不單只是對離任者在任職期間履行經濟責任客觀公正地評價，還可以成為對后續領導人員實施任前監督的標準，利用離任審計的雙重效果可以避免重復審計，提高工作的效率性與準確性。還可以將任期審計、離任審計和期后追蹤審計三者動態的結合，真正查清離任者離任后過一段時間才暴露出來的問題，分清是非，劃清后續領導與離任領導之間的責任歸屬。
2、注重結合，提高效率。
可以把經濟責任審計同常規的財務審計、專項資金審計及財政預算執行審計結合起來，做到一次進行兩項任務，高校審計處在安排年度計劃時，做到常規審計、專項資金及預算執行審計與經濟責任審計有機結合，在出具常規審計報告的同時，建立經濟責任審計記錄臺賬和審計檔案。這樣做，可以發揮審計人員的整體合力，還能夠減輕經濟責任審計的壓力。
3、重視審計評價，保證報告質量。
在高校經濟責任審計評價上堅持六項原則，即客觀性、準確性、全面性、統一性、量化性、謹慎性原則。在具體操作上可以把握“五條標準”，劃清“六個界限”。“五條標準”一是對審計查實的情況進行評價，未經審計的情況不評價。二是未經核實的指標和證據不充分的經濟事項不評價。三是圍繞審計事項的內容評價。四是對個人廉政情況，未發現問題的一般只作客觀說明。一經發現有個人違紀違規問題線索，及時按規定向有關機關移送。五是評價用語采用直接陳述，不用主觀修飾性語言，緊扣經濟責任，采取寫實、量化的評價方法。“六個界限”即：前任責任與現任責任的界限;直接責任與主管責任的界限;國家政策、法規不配套、不健全與鉆改革空子、謀取小團體和個人私利的界限;改革措施失誤與玩忽職守的界限;主觀責任與客觀責任的界限;一般違紀與重大違紀的界限。
三、加強學習，強化素質，努力提高經濟責任審計質量
提高高校經濟責任審計的一個重要途徑，是提高審計人員的整體素質。領導干部任期經濟責任審計涉及到對領導個人的評價，審計人員在恪守審計職業道德的同時，要努力提高自身的業務素質。一要多學習一些宏觀經濟的知識，提高分析問題的能力;二要多學習一些現代審計方式和方法，學習運用好計算機輔助審計;三要積極進取，開拓創新，提高工作效率，勇于揭露矛盾和問題，做到審計結論既能使被審者服氣，又能使領導和群眾滿意。
綜上所述，重視高校領導干部經濟責任審計，不但是時代和形勢發展的需要，同時也是高校審計工作自身發展的需要。